Xã Yên Phong nằm ở phía đông huyện Yên Mô, cách trung tâm thành phố Ninh Bình 19 km, có vị trí địa lý:

• Phía đông giáp huyện Yên Khánh
• Phía nam giáp xã Yên Từ
• Phía tây và phía bắc giáp thị trấn Yên Thịnh.

Xã Yên Phong có diện tích 8,01 km², dân số năm 2019 là 8.775 người[1], mật độ dân số đạt 1.096 người/km².

Đây cũng là một xã nằm bên bờ sông Vạc. Xã này có quốc lộ 12B (tỉnh lộ 480 cũ) nối từ Quốc lộ 1A tại Mai Sơn qua Thị trấn Yên Thịnh đến Quốc lộ 10 tại Lai Thành.